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¿Pueden usarse animales cruzados en selección genómica?

Opened Access ¿Pueden usarse animales cruzados en selección genómica?
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Título Alternativo: ¿Can crossbred animals be used for genomic selection?
Autor: Ibáñez-Escriche, N.
Fernando, R.L.
Dekkers, J.C.M.
Fecha: 2008
Publicado en: XIV Reunión Nacional de Mejora Genética Animal (2008),
Tipo de documento: Ponencia
Resumen: La producción en poblaciones “puras” suele tener una baja reproducibilidad en sus descendentes “cruzados”. La selección genómica podría utilizarse para evaluar poblaciones “puras” usando los datos de sus descendientes “cruzados”. Sin embargo, en las poblaciones cruzadas quizás el desequilibrio de ligamiento (LD) no esta restringido a marcadores estrechamente ligados al QTL y los efectos de los marcadores podrían ser específicos de cada población. Estos dos problemas podrían solucionarse utilizando un modelo con los alelos de los SNPs específicos para cada población. Para investigar esta idea usamos un modelo con los efectos de los genotipos de los SNPs (modelo 1) y otro modelo con los efectos de alelos de los SNPs específicos para cada población (modelo 2). Ambos modelos se utilizaron para predecir los valores genéticos de las poblaciones “puras” usando datos F1. Tres situaciones fueron simuladas, en las dos primeras se consideró que las dos poblaciones tenían un mismo origen con una ...
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Performance of purebred parents can be a poor predictor of performance of their crossbred descendants. However, in crossbred populations linkage disequilibrium may not be restricted to markers that are tightly linked to the QTL and the effects of SNPs may be breed specific. Both these problems can be addressed by using a model with breed-specific SNP effects. To investigate this idea, we used a model with effects of SNP genotypes (model 1) and a model with breed-specific effects of SNP alleles (model 2) to predict purebred breeding values using F1 data. Three scenarios were considered. In the first two, pure breeds were assumed to have a common origin either 50 or 550 generations ago. In the third scenario, the two breeds did not have a common origin. In all these scenarios, the two breeds were used to generate an F1 with 1,000 individuals. Trait phenotypic values controlled by 12 segregating QTL and with a heritability of 0.30 were simulated for the F1 individuals. Further, 500 segre...
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Cita: Ibáñez-Escriche, N., Fernando, R.L. y Dekkers, J.C.M. (2008). ¿Pueden usarse animales cruzados en selección genómica?. En XIV Reunión Nacional de Mejora Genética Animal Diputación Provincial de Sevilla: ITEA.
Tamaño: 59.37Kb
Formato: PDF

URI: http://hdl.handle.net/11441/43165

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