Extracción de patrones de comportamiento en datos de expresión genómica

Abstract

Los algoritmos de biclustering persiguen obtener subconjuntos de genes que se expresan de una manera similar frente a un subconjunto de condiciones. Resulta necesario por tanto poder determinar la calidad de los biclusters obtenidos. En este artículo se presenta una técnica basada en programación lineal para la extracción de patrones de desplazamiento en biclusters, pudiendo de esta manera dar una medida de cómo se ajustan los genes de dichas submatrices a un patrón de comportamiento. Los resultados obtenidos son comparados con los que se obtienen utilizando computación evolutiva.