Efecto de la consanguinidad sobre la longevidad de cerdas Landrace

Abstract

La consanguinidad es un fenómeno biológico de especial relevancia en las especies domésticas, pudiéndose caracterizar tanto en términos de coeficiente de consanguinidad como fraccionando la contribución de cada individuo fundador en coeficientes de consanguinidad parcial (CP). A partir de los registros de longevidad de 4.226 cerdas de raza Landrace, este trabajo se ha centrado en la modelización de los CP bajo modelos Weibull de riesgos proporcionales y su posterior comparación mediante el DIC (deviance information criterion). Se asumieron tres distribuciones a priori distintas para los efectos de CP, resultando la normal asimétrica (DIC = 55.064,6) claramente preferible a la normal simétrica (DIC = 55.069,2) y a la distribución uniforme (DIC = 55.077,9). Se descartó, también, el modelo estándar con la consanguinidad global de cada individuo (DIC = 55.078,4). En el caso del modelo con DIC mínimo, la distribución posterior de los efectos de CP fue claramente asimétrica, con el 85,15% de las estimas afectando negativamente a la longevidad de las cerdas y el 14,85% restante con efecto neutro o incluso positivo. Señalar por último, que la heredabilidad para el carácter longevidad fue de 0,159.

Inbreeding is a biological phenomenon of special relevance in domestic species, where the overall inbreeding coefficient can be partitioned in founder-specific partial inbreeding (PI) coefficients. Taking longevity data of 4,226 Landrace sows as starting point, this research proposed alternative parameterization for PI effects under Weibull proportional hazard models, and compared their performance through the deviance information criterion (DIC). Three different a priori distributions were assumed for PI effects, asymmetric normal (DIC = 55,064.6), symmetric normal (DIC = 55,069.2) and flat (DIC = 55,077.9). Additionally, the standard model accounting for the overall inbreeding coefficient was clearly discarded (DIC = 55,078.4). For the model with asymmetric Gaussian prior, the posterior distribution of PI effects was clearly skewed. An 85.15% of the estimates showed negative effect on sow longevity whereas the remaining 14.85% ones had null or even positive effect on sow survival. Estimated heritability was 0.159.