Caracterización epidemiológica y clínica de la infección y colonización por Escherichia coli perteneciente al complejo clonal O25b/ST131

Abstract

Introducción. Escherichia coli secuenciotipo 131 (ST131) es un clon que combina capacidad de propagación exitosa, resistencia a los antibióticos y virulencia; de hecho, los aislamientos de ST131 generalmente exhiben los factores de virulencia asociados característicos de las cepas de E. coli patógenas extraintestinales (ExPEC). Este clon se ha diseminado rápidamente por todo el mundo en las últimas décadas, contribuyendo de forma importante al aumento de la prevalencia de resistencia a los antimicrobianos en E. coli. Sin embargo, la información sobre la epidemiología e impacto clínico de E. coli ST131 es limitada. La mayoría de los estudios epidemiológicos sobre colonización intestinal o infecciones causadas por ST131 se han realizado en aislamientos que producen β-lactamasas de espectro extendido (BLEE); sin embargo, la mayoría de los aislados de ST131 no producen estas β-lactamasas. Lo mismo ocurre con el impacto clínico de las infecciones. Esto se debe a que los aislados de ST131 carecen de un marcador fenotípico específico, por lo que deben aplicarse métodos moleculares a una gran cantidad de aislamientos de E. coli para identificar a los que pertenecen al grupo clonal ST131.

Objetivos. (1) Describir la prevalencia de colonización intestinal por E. coli ST131 (productor y no productor de BLEE) en convivientes y contactos hospitalarios en pacientes con infección por este microorganismo. (2) Identificar los factores de riesgo asociado a la colonización intestinal por E. coli ST131 (productor y no productor de BLEE) en convenientes y contactos hospitalarios de pacientes con infección por estos microorganismos. (3) Identificar los factores de riesgo para la bacteriemia por E. coli ST131 no productor de BLEE. (4) Evaluar el impacto pronóstico de los aislados de E. coli ST131 no productor de BLEE causantes de la bacteriemia.

Metodología. Los objetivos 1 y 2 se estudiaron mediante estudio de cohortes en 34 grupos (clusters) de convivientes comunitarios y 30 de contactos hospitalarios de otros tantos casos índice (pacientes que habían sufrido una infección por E. coli ST131). La colonización rectal por ST131 E. coli se estudió en todos los participantes mediante la realización de hisopos rectales en la primera semana tras la detección del caso índice, y 1 y 3 meses después. Los factores de riesgo para la bacteriemia por E. coli ST131 se realizó un estudio de casos y controles; los casos fueron los pacientes con bacteriemia por estos microorganismos; los dos siguientes pacientes con bacteriemia por E. coli no-ST131 del mismo centro fueron elegidos como controles si ocurrieron en menos de un mes del caso correspondiente. Finalmente, el impacto pronóstico de la bacteriemia por ST131 se estudió en la cohorte de pacientes con bacteriemia por ST131 y no-ST131. Los pacientes de ambos estudios fueron prospectivamente incluidos tras estudiar en tiempo real los aislados de E. coli mediante PCR para O25b rfb y el alelo 3 del gen pabB, y multiplex PCR para filogrupo B23. Los estudios se realizaron en dos hospitales de tercer nivel que asisten a 1.100.00 habitantes entre enero de 2010 y octubre de 2012 en la provincia de Sevilla.

Resultados. Se detectó colonización por E. coli ST131 en algún momento en 18/64 (28,1%) de los convivientes de casos índice comunitarios, lo que ocurrió en 13/34 (28,2%) de los conglomerados (clusters) domiciliarios; y en 8/54 (14.8%) contactos de

casos nosocomiales, lo que ocurrió en 8/30 (26.6%) conglomerados (clusters) nosocomiales. Las variables asociadas con la colonización por ST131 en los contactos comunitarios en el análisis ajustado multinivel fueron el uso de inhibidos de la bomba de protones en el nivel individual (OR ajustada: 3,08; intervalo de confianza [IC] al 95%: 0,88-10,80; p=0,07) y la edad del paciente índice en el nivel de clusters (OR ajustada: 1,05 por año; IC 95% 1,01-1,10; p=0,05). En los casos nosocomiales, solo se precisó realizar el análisis multivariante con las variables del nivel individual, siendo el ser dependientes para las actividades básicas (OR ajustada: 21,1; IC 95%: 3,62-160,0; p=0,001) y ser portador de catéter urinario (OR ajustada: 8,4; IC 95%: 0,97-76,9; p=0.05) las asociadas a mayor riesgo de colonización.

En cuanto a las bacteriemias, sólo la cirugía reciente (OR = 7.03, IC 95% 1.71–28.84; P = 0.007) y el origen desconocido de la bacteriemia (OR = 5.37, IC 95% 0.93–30.81; P = 0.05) se asociaron con mayor riesgo de ST131. El que el aislado fuera ST131 no se asoció con la mortalidad (OR ajustada: 0,53; IC 95% 0,18-1,57; p=0,26), fracaso clínico en el día 14 (OR ajustada: 0,60; IC 95%: 0,15-2,33; p=0.46) o presentación en forma de sepsis grave o shock séptico (OR ajustada: 0,81; CI 95%: 0,30-2,15; p=0,67).

Conclusiones. La prevalencia de colonización intestinal por E. coli ST131 (productor y no productor de BLEE) fue mayor en convivientes que en contactos hospitalarios. Se han identificado factores asociados a mayor riesgo de colonización intestinal en convivientes y contactos nosocomiales, así como a mayor riesgo de bacteriemia por E. coli ST131 no productor de BLEE. Finalmente, la bacteriemia por E. coli ST131 no productor de BLEE no se asoció con mayor gravedad o mortalidad respecto a otros clones de E. coli.