Desarrollo de marcadores genéticos de microsatélites para especies de plantas del género Phlomis mediante técnicas de Next-Generation Sequencing (NGS)

Abstract

La diversidad genética da lugar a la evolución de las especies, permitiéndoles adaptarse al medio ambiente cambiante, y contribuyendo de este modo a la genética de conservación de las poblaciones de organismos. Esta diversidad genética se mide con marcadores moleculares o genéticos, siendo los marcadores de microsatélites los más empleados. En este trabajo se disponía de una serie de marcadores obtenidos por técnicas de Next-Generation Sequencing (NGS), de dos especies endémicas del género Phlomis: Phlomis lychnitis y Phlomis crinita subsp. Malacitana. De las cuales se quería obtener el potencial de amplificación y variabilidad, además de calcular los parámetros básicos de la diversidad genética para así poder determinar el potencial de estos marcadores para futuros estudios de hibridación. Nuestros resultados muestran un conjunto de 10 marcadores de microsatélites que presentaban variabilidad, es decir, marcadores que presentaban diferentes alelos en las muestras, por tanto, polimórficos; y 12 monomórficos, los cuales presentaban un único alelo en la misma posición por lo que no presentaban variabilidad. Para probar la capacidad diagnóstica de los marcadores que presentaron variabilidad se realizó un análisis de coordenadas principales (PCoA) para ordenar los genotipos multilocus de cada individuo en un espacio multidimensional. Esta representación determinó la capacidad de diferenciar genéticamente las dos especies, al tratarse de dos poblaciones puras. Por ello, podemos afirmar que el conjunto de marcadores empleados es bueno para discernir entre las dos especies estudiadas. En un futuro este estudio se podría transferir a otras especies endémicas del género Phlomis.