Caracterización histológica y molecular de una serie de casos de melanoma uveal primario con correlación clínica y pronóstica

Abstract

Introducción: El melanoma uveal (MU) es la neoplasia maligna primaria más frecuente del ojo, para la que no existen terapias eficaces cuando la enfermedad se disemina y en la que es muy importante conocer su pronóstico. El propósito de este trabajo es caracterizar mediante técnicas de secuenciación masiva (NGS) el perfil mutacional de una serie de MUs para buscar marcadores de utilidad pronóstica y terapéutica. Material y métodos: Hemos realizado un estudio retrospectivo observacional de 69 casos de MU diagnosticados en el Hospital Universitario Virgen Macarena. Para la captura híbrida de las regiones objetivo del estudio, en los primeros 38 casos, se empleó un panel de 519 genes basado en SureSelect HS2 (Agilent Technologies). Para la captura de las zonas dianas en los siguientes 31 casos se utilizó un Kit personalizado con un panel que incluía los 28 genes más frecuentemente mutados en la primera serie. Resultados: Se valoraron un total de 231 variantes genéticas que afectaban a la función de la proteína. Las mutaciones secundarias más frecuentes se produjeron en SF3B1 (en el 26%), seguido de BAP1 (en el 23%), LRP1B (22%) y FGFR4 (20%). La mutación de BAP1 se asoció con una mayor probabilidad de metástasis y con una mayor presencia de células epitelioides. LRP1B también se asoció con la presencia de células epitelioides. La mutación de SF3B1 se asoció significativamente con una morfología fusiforme. Encontramos variantes en RAD51B, TOP2A, PTPRD, TSC2, DHX9, PDK1 y MTOR que no se habían notificado previamente en las bases de datos consultadas. Los MUs que presentaron un subtipo histológico epitelioide, infiltración extraescleral o de cuerpo ciliar, mutación en BAP1, CHEK2, TSC2, DICER o IDO1 tienen más riesgo de producir metástasis en cualquier momento del seguimiento. Conclusiones: BAP1 es el biomarcador más sólido de mal pronóstico en MU y sus mutaciones pueden detectarse mediante NGS. SF3B1 se asocia con el subtipo de células fusiformes, lo que le confiere probablemente un valor pronóstico favorable. Nuestro estudio sugiere que las mutaciones en CHEK2, TSC2, DICER o IDO1 pueden tener valor pronóstico. El diagnóstico rutinario de MU debe de completarse con el análisis mutacional de los genes con implicación pronóstica mediante técnicas de secuenciación dirigida.

Introduction: Uveal melanoma (UM) is the most common primary malignancy of the eye and there are no effective therapies for disseminated disease. It is important to try to know the patient’s prognosis. The purpose of this work is to characterize by massive sequencing techniques (NGS), the mutational profile of a series of UMs, to search for markers of prognostic and therapeutic utility. Material and methods: We have performed a retrospective observational study of 69 cases of UM diagnosed in the Hospital Universitario Virgen Macarena. For the hybrid capture of the target regions of the study, a panel of 519 genes based on SureSelect HS2 (Agilent Technologies) was used in the first 38 cases. For the capture of the target regions in the second cohort of cases, a custom kit was used with a panel including the 28 most frequently mutated genes in the first series. Results: A total of 231 genetic variants affecting protein function were assessed. The most frequent secondary mutations occurred in SF3B1 (in 26%), followed by BAP1 (in 23%), LRP1B (22%) and FGFR4 (20%). BAP1 mutation was associated with an increased likelihood of metastasis and with an increased presence of epithelioid cells. LRP1B was also associated with the presence of epithelioid cells. SF3B1 mutation was significantly associated with spindle-shaped morphology. We found variants in RAD51B, TOP2A, PTPRD, TSC2, DHX9, PDK1 and MTOR that were not previously reported in the databases consulted. UMs presenting with a epithelioid histological subtype, extrascleral or ciliary body infiltration, mutation in BAP1, CHEK2, TSC2, DICER or IDO1 are at higher risk of producing metastases at any instant of follow-up. Conclusions: BAP1 is the strongest biomarker of poor prognosis in UM and its mutations can be detected by NGS. SF3B1 is associated with the spindle cell subtype of UM, which probably confers a favorable prognostic value. Our study suggests that mutations in CHEK2, TSC2, DICER or IDO1 may have prognostic value. Routine diagnosis of uveal melanoma should be completed with mutational analysis of genes with prognostic implication by targeted sequencing techniques.