Evaluación de biclusters mediante intra-fluctuaciones mínimas: un enfoque multi-objetivo

Abstract

Las técnicas de biclustering aplicadas a datos de expresión génica persiguen la extracción de subconjuntos de genes co-expresados frente a subconjuntos de condiciones. Una de las medidas usada más frecuentemente para cuantificar la calidad de los biclusters es el residuo cuadrático medio, la cual ha sido incorporada en diferentes métodos produciendo resultados satisfactorios. Sin embargo, el uso de esta medida no garantiza encontrar cierto tipo de biclusters. En este trabajo se propone una nueva medida para solventar dicha deficiencia, basada en el cálculo del area comprendida entre dos curvas, construidas a partir de los valores de expresión. Para poder comprobar la eficiencia de la medida propuesta, ésta ha sido incorporada como uno de los objetivos en un algoritmo evolutivo multi-objetivo, confirmando los resultados obtenidos la calidad de dicha medida.