Evaluación de biclusters en un entorno evolutivo

Abstract

La mayoría de las heurísticas utilizadas para la búsqueda de biclusters en microarrays hacen uso del residuo cuadrático medio (MSR) como medida de evaluación de las distintas soluciones generadas. El uso de MSR permite obtener biclusters importantes, sin embargo, recientemente se ha demostrado que dicha medida no es válida para reconocer determinados tipos de biclusters. En este trabajo se propone una nueva medida para la evaluación de biclusters, denominada Error Virtual (VE), y que ha sido incorporada en el contexto de un algoritmo de búsqueda evolutivo, con el fin de comprobar su validez. Los resultados experimentales que se obtienen aplicando dicha heurística muestran que el uso de esta nueva medida produce biclusters interesantes, que no podrían haber sido generados con el uso del residuo cuadrático medio.