Sistemas de secreción tipo VI (T6SS) en Rhizobiales. Estudio in sílico del clúster de s. FREDII USDA257

Abstract

El sistema de secreción tipo VI (T6SS) es una maquinaria bacteriana a través de la cual se secretan toxinas/efectores al interior de células eucariotas y/o procariotas. Este sistema se ha visto involucrado en patogénesis, pero su papel fundamental es la competición entre bacterias. En este trabajo, se aborda el estudio de los T6SSs en el orden Rhizobiales, donde la función del T6SS es desconocida. En primer lugar, hemos llevado a cabo un análisis filogenético de los T6SSs en Rhizobiales para posteriormente centrarnos en la caracterización del clúster del T6SS de Sinorhizobium fredii USDA257, una cepa de especial interés en agricultura por su amplio rango de nodulación. Nuestro análisis filogenético muestra que los T6SS del orden Rhizobiales están distribuidos principalmente en dos grupos (grupo 3 y 5), de los cinco descritos en la literatura para los T6SSs. El análisis bioinformático del T6SS de nuestro organismo modelo S. fredii USDA257 muestra que el clúster génico contiene todos los genes necesarios para la biosíntesis de las proteínas estructurales necesarias para ensamblar un T6SS activo. Además, hemos encontrado genes accesorios que codifican proteínas reguladoras y estructurales que regulan el sistema y confieren nuevas características funcionales al mismo (TagF, TagM, TagL y TagY). El estudio in sílico también nos ha permitido identificar genes (USDA_c28430, USDA_c28470 y USDA_c28480) que codifican los posibles efectores Vgrge, Tre2 y Tre1, respectivamente. Las predicciones funcionales de estos efectores indican que podrían estar relacionados con la degradación de la pared celular vegetal. En este caso, serían los primeros efectores de tipo VI descrito, involucrado en el establecimiento de la simbiosis Rhizobium-leguminosa y que actuarían de manera conjunta con el sistema de secreción tipo III para llevar a cabo este proceso.