Utilización de la resonancia magnética nuclear en el diseño de fármacos: "SAR by NMR"

Abstract

La espectroscopía de Resonancia Magnética Nuclear, RMN es una herramienta muy valiosa en el diseño de fármacos, ya que es un método a partir del cual se puede obtener muy diversa información, como conocer la información estructural de una molécula, distinguir entre dos conformaciones de un mismo compuesto o detectar interacciones entre distintas moléculas como es el caso de las interacciones fármaco-receptor. Toda esta información se obtiene gracias al estudio de las señales de los diferentes núcleos que se observan en el espectro de la molécula estudiada y las perturbaciones que se producen por la presencia de otras entidades. Por medio del desplazamiento químico y de otros parámetros, podemos conocer mejor a la molécula estudiada y obtener mayor información, con el objetivo de desarrollar nuevos ligandos para una diana farmacológica concreta. Conocer la interacción entre ligando y proteína diana es clave en el diseño de fármacos. Aquí es donde juega un papel crucial la RMN, ya que permite correlacionar los cambios que se producen en una molécula diana cuando un ligando se une a ella, con los cambios en los desplazamientos químicos que se observan al comparar los espectros antes y después de la unión. La interacción que se produce se puede estudiar centrándose en el ligando o en la diana, y aunque existen diversas técnicas dentro de cada tipo, son más numerosas las que estudian el ligando. En cambio, las técnicas que estudian la diana son más específicas y tienen mayor rendimiento. Uno de estos últimos métodos, que se centran en la proteína diana, es el que permite conocer las Relaciones Estructura-Actividad por medio de la RMN, conocido como SAR by RMN, que se basa en identificar cabezas de serie que interaccionen con el sitio activo de la diana y optimizarlos hasta conseguir un ligando de gran afinidad por la diana