Análisis del genoma ovino para la identificación de QTL con influencia sobre caracteres de morfología mamaria: resultados preliminares

Abstract

El objetivo del presente estudio es la localización de regiones genómicas con influencia sobre caracteres de morfología mamaria en ganado ovino, utilizando la metodología de genome scan, o barrido genómico. Con este fin, se ha analizado una población comercial de ganado ovino de raza Churra, organizada en un diseño hija compuesto por 8 familias de medio-hermanas. Un total de 182 marcadores genéticos, distribuidos uniformemente a lo largo del genoma ovino autosómico, fueron genotipados en la población objeto de estudio. Como medidas cuantitativas se utilizaron las desviaciones calculadas para los caracteres de morfología mamaria considerados en el programa de mejora genética de la raza ovina Churra: inserción de la ubre, posición de los pezones, tamaño de los pezones, profundidad y forma global de la ubre. Para la identificación de los QTL se realizó un análisis de regresión de los fenotipos con marcadores flanqueantes. El análisis del genoma para el conjunto de la población permitió la identificación de 11 regiones asociadas con estos caracteres, al nivel chromosome-wise, en los siguientes cromosomas: 4, 6, 7, 8, 10, 14, 15, 20, 22, 23 y 26. Para las asociaciones significativas se debe realizar una verificación previamente al abordaje del mapeo fino.

Analysing the ovine genome to detect QTL for mammary morphology: preliminary results The objective of this work was the identification of chromosomal regions influencing udder morphology traits in dairy sheep by using the genome scan approach. For this purpose, we have analyzed a commercial population of Spanish Churra sheep organized according a daughter design, which included 8 half-sib families. A total of 182 genetic markers, evenly distributed along the ovine autosome, were genotyped in the studied population. As quantitative measurements for the analysis, we used the yield deviations calculated for each of the udder traits considered in the breeding program of Churra sheep: udder attachment, teat position and teat size, udder depth and udder shape. A multimarker regression analysis was used to detect QTL. The whole genome analysis allowed the identification of 11 chromosome-wide significant regions associated with the traits analyzed in the following chromosomes: 4, 6, 7, 8, 10, 14, 15, 20, 22, 23 y 26. Confirmation of the detected effects is required before attempting future fine mapping studies on these regions.