Caracterización de la población de Fusarium oxysporum f. sp. dianthi en la costa Noroeste de Cádiz y control mediante composts supresivos de las marchiteces vasculares

Abstract

Las marchiteces vasculares constituyen uno de los tipos de enfermedades vegetales más importantes y estudiadas de las causadas por hongos. Los principales agentes causantes de este tipo de enfermedad son: Fusarium oxysporum (Schlecht ex Fries) (Fusariosis vasculares) y Verticillium dahliae Kleb. (Verticilosis vasculares). En la búsqueda de alternativas sostenibles, las sociedades desarrolladas generan una gran cantidad de residuos orgánicos procedentes de la industria agrícola. Estos residuos tras un proceso de compostaje podrían ser usados como sustratos hortícolas. Además, algunos composts de alta calidad o bien sustratos enriquecidos con agentes de control biológico inciden disminuyendo las enfermedades producidas por algunos de los principales hongos fitopatógenos, siendo además una alternativa al Bromuro de Metilo en los cultivos en contenedor, presentando un fenómeno denominado supresividad.

En este sentido, la presente Tesis Doctoral se desglosa en dos objetivos: el estudio de la diversidad y prevalencia racial de una población de Fusarium oxysporum f. sp. dianthi (Fod) obtenida de plantas enfermas en una zona con una alta tradición en el cultivo del clavel (Noroeste de la provincia de Cádiz); y la evaluación de sustratos formulados con composts de residuos agroindustriales en cuatro patosistemas (Fusarium/clavel, Fusarium/tomate, Verticillium/algodón y Verticillium/olivo) y el estudio de los factores implicados en esos fenómenos supresivos.

We surveyed the diversity of races and prevalence of pathogenic populations of Fusarium oxysporum f. sp. dianthi (Fod) in an area in the northwest of the province of Cadiz (Spain). From 54 farms, 132 isolates were collected from wilted carnation plants. Molecular techniques, namely phylogenetic studies [using RAPD-PCR fingerprinting and sequencing of the transcription elongation factor (TEF1-α)] and analysis with racespecific molecular markers were used to characterize these isolates. Selected isolates from RAPD groups were phenotypically evaluated by pathogenicity tests. All these data showed that Fod race 2 was the most frequent and prevalent race in the study area, followed by race 1 or 8. Moreover, phylogenetic analyses showed similar results, which were different to those of the race-specific PCR assays. Three findings were highlights from these results: i) seven isolates were not classified in groups where Fod testers were clustered, even they showed different results when race-specific markers were used, ii) ten isolates with retarded race 1 or 8 specific-band were characterized as F. proliferatum by TEF1-α gene sequencing and clustered into an outgroup, and iii) six isolates failed to generate an amplification signal using race-specific markers. Furthermore, three of them were grouped close to the race 2 tester according to the phylogenetic analyses, and showed the same differential pathogenicity as race 2. This may indicate the presence of a Fod race 2 subgroup in this region.