Análisis de los patrones de expresión génica en el carcinoma colorrectal: desarrollo de biomarcadores predictivos de respuesta a la quimioterapia en pacientes con enfermedad avanzada

Abstract

La quimioterapia basada en fluoropirimidinas ha sido la base del tratamiento del cáncer colorrectal metastásico (CCRm) durante años. Sin embargo, tan sólo aproximadamente la mitad de los pacientes tratados alcanzan respuestas tumorales objetivas y, hasta la fecha, no disponemos de herramientas fiables que permitan identificar de forma prospectiva a aquellos pacientes que presentan mayor probabilidad de beneficiarse del tratamiento. El objetivo de este estudio fue la identificación de un perfil de expresión génica predictivo de respuesta a la quimioterapia en CCRm. Con este fin, se realizó la hibridación en microarrays (Affymetrix GeneChip® HGU133 Plus 2.0) del genoma completo de muestras tumorales congeladas en fresco de una cohorte inicial de 37 pacientes con CCRm. Los perfiles de expresión génica en las dos condiciones del estudio (respondedores a la quimioterapia de primera línea versus no respondedores) se compararon mediante análisis bioinformático supervisado, identificándose un panel de 161 genes diferencialmente expresados en pacientes respondedores (23 pacientes; 62%) con respecto a los no respondedores (14 pacientes; 38%). Estos genes fueron seleccionados para su evaluación mediante qRT-PCR TaqMan®Low Density Arrays (TLDA) 7900 HT Micro Fluidic Cards) en una cohorte independiente multicéntrica que incluyó muestras de 53 pacientes. Siete de estos genes fueron validados como predictores de respuesta a quimioterapia en CCRm. Los pacientes con un perfil de expresión favorable presentaron tasas de respuesta (58% vs 13%, p=0.024), supervivencia libre de progresión (61% vs 13% a 1 año, HR=0.32, p=0.009) y supervivencia global (32 vs 16 meses, HR=0.21, p=0.003) significativamente mayores que los pacientes con un perfil de expresión no favorable. Este ha sido el primer estudio en validar un perfil de expresión génica predictivo de respuesta a la quimioterapia en pacientes con CCRm. Sin embargo, serán necesarios estudios prospectivos y con mayor número de pacientes para confirmar estos hallazgos y poder trasladar a la clínica herramientas útiles que permitan optimizar la selección del tratamiento más adecuado para cada paciente.