García Rondón, Ana2025-06-272025-06-272025-03-24Maraver-Cárdenas, P. (2025). Mechanism of transcription termination: Role of chromatin and R-loops. (Tesis Doctoral Inédita). Universidad de Sevilla, Sevilla.https://hdl.handle.net/11441/174728La transcripción llevada a cabo por la ARN polimerasa II (RNAPII) es un proceso fuertemente regulado que se compone de tres fases: iniciación, elongación y terminación. De todas ellas, la terminación es la etapa menos estudiada y comprendida, sin embargo, de ella dependen procesos esenciales como la expresión génica, el reciclaje de las polimerasas o la prevención de la interferencia génica. Esta tesis explora los mecanismos por los cuales los híbridos de ARN:ADN (R-loops) y la dinámica de la cromatina influyen en la terminación de la transcripción en la levadura Saccharomyces cerevisiae. Históricamente asociados con la inestabilidad genómica, los R-loops desempeñan un papel como reguladores de la terminación de la transcripción. En este estudio, hemos utilizado un novedoso sistema basado en NPL3 con secuencias propensas a formar R-loops insertadas tras el sitio de poliadenilación (PAS) canónico demostrando que estos híbridos son capaces de cambiar el patrón del procesamiento en el 3’ del ARN en circunstancias donde existen sitios de poliadenilación alternativos. Además, demostramos que la exonucleasa Rat1 desempeña un papel en la resolución de bloqueos transcripcionales causados por R-loops a nivel genómico, mediando la terminación prematura de la RNAPII. Por otra parte, se ha llevado a cabo un escrutinio para la búsqueda de nuevos factores relacionados con el metabolismo de la cromatina implicados en el proceso de terminación de la transcripción. Esta búsqueda nos ha permitido identificar al complejo remodelador de cromatina SWI/SNF como un actor importante en la terminación de la transcripción de un conjunto de genes de S. cerevisiae. Más allá de su rol establecido como un complejo remodelador dependiente de ATP, SWI/SNF parece promover la terminación al interactuar con la maquinaria de corte y poliadenilación, subrayando un mecanismo único entre los remodeladores de cromatina mediante el cual SWI/SNF contribuye a la disociación de la RNAPII. En conjunto, este estudio analiza el posible papel de los R-loops y la cromatina en la terminación de la transcripción, ampliando nuestra comprensión de los mecanismos de terminación en levaduras y desvelando posibles implicaciones en otros procesos como la desregulación transcripcional en enfermedades como el cáncer, donde los R-loops y los defectos de terminación son prominentes. Al integrar enfoques genéticos, bioquímicos y genómicos, esta tesis subraya la importancia del equilibrio entre la elongación y la terminación para mantener la fidelidad transcripcional.application/pdf182 p.engAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internationalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccess