Este archivo ha sido creado el [06-02-2024] por [José Antonio Mejías Gimeno] GENERAL INFORMATION ------------------ 1. Dataset title: Sistemática y Filogenia de Sonchus boulosii sp. nov. [Dataset] 2. Authorship: Name: José Antonio Mejías Gimeno Institution: Universidad de Sevilla Email: jmejias@us.es ORCID: 0000-0001-6393-6496 DESCRIPTION ---------- 1. Dataset language: Spanish/English 2. Abstract: Dataset acquired for the description and analysis of phylogenetic position of the new species Sonchus boulosii (Asteraceae). The dataset provided the material for the publication of the paper: Phylogenetic and morphological analysis of a new cliff‑dwelling species reveals a remnant ancestral diversity and evolutionary parallelism in Sonchus (Asteraceae). We performed a morphological characterization of the species, analysed chromosome number and chromosome morphology and evaluated systematic position by means of ITS/ETS and matK regions sequencing. We also performed the taxonomic description and publication of de new species, as well as a new section in the genus Sonchus. We discussed evolutionary processes involved in the origin of Sonchus boulosii 3. Keywords: Homoplasy, Karyogram, , matK cpDNA, nrDNA ITS, parallel evolution, western Mediterranean, biodiversity, new species, Asteraceae Systematics 4. Date of data collection (fecha única o rango de fechas): 30-06-20214 to 18-05-2018 5. Publication Date: 06-02-2024 6. Grant information: Grant Agency [Organismo financiador]: Emirates Center for Wildlife Propagation (ECWP) Grant Number [Código del proyecto]: Convenio Universidad de Sevilla (Cod. 2014/00000964) 7. Geographical location/s of data collection: Morocco: Eastern Morocco mountains, Middle Atlas, High Atlas ACCESS INFORMATION ------------------------ 1. Creative Commons License of the dataset: CC-BY 2. Dataset DOI: https://doi.org/10.12795/11441/154795 3. Related publication: José A. Mejías, Mathieu Chambouleyron, Seon-Hee Kim, M. Dolores Infante, Seung-Chul Kim, Jean-François Léger. 2018. Phylogenetic and morphological analysis of a new cliff‑dwelling species reveals a remnant ancestral diversity and evolutionary parallelism in Sonchus (Asteraceae). Plant Systematics and Evolution, 304: 1023-1040. https://doi.org/10.1007/s00606-018-1523-2 4. Link to related datasets: [Recomendado si es aplicable | (Ej. Otros conjuntos de datos del mismo proyecto) siguiendo el formato.] DOI/URL: VERSIONING AND PROVENANCE --------------- 1. Last modification date: 24-01-2024 2. Were data derived from another source?: NO 3. Additional related data not included in this dataset: NO METHODOLOGICAL INFORMATION ----------------------- [Descripción de la metodología empleada para generar el conjunto de datos.] [No copie y pegue el texto de la sección de metodología de un documento que está pendiente de publicación, a no ser que te conste que está permitido: algunas editoriales podrían considerarlo como una publicación previa y no aceptar su manuscrito.] [Si ha de hacer referencia a un artículo no publicado, proporcione la máxima información de que dispone.] [Incluya el DOI en las referencias.] 1. Description of the methods used to collect and generate the data: [Recomendado | Referenciar, en el estilo estándar de su disciplina, las publicaciones o documentos que contengan el diseño experimental o los protocolos empleados en la recogida de datos..] 2. Data processing methods: [Recomendado | Describir cómo se ha generado el conjunto de datos publicado a partir de los datos primarios recogidos.] 3. Software or instruments needed to interpret the data: [Obligatorio si es aplicable | Incluya la versión del software. Si hay un software específico de acceso restringido, explique cómo se puede obtener. Valore si es posible cambiar el conjunto de datos a un formato abierto (recomendado).] 4. Information about instruments, calibration and standards: [Obligatorio si es aplicable] 5. Environmental or experimental conditions: [Obligatorio si es aplicable | Ej .: influencias atmosféricas, entorno computacional, etc.] 6. Quality-assurance procedures performed on the data: [Opcional] FILE OVERVIEW ---------------------- 1. Explain the file naming conversion, si es aplicable: File naming based on dataset provided for Sonchus boulosii. 2. File list: File name: 1.Sonchus_boulosii_MORPHOLOGY.xls Description: Record of the states of 32 morphological traits for 21 dry specimens of Sonchus boulosii coming form the known populations File format: Excel Variable list: Locality , Diameter of the base in an individual, Rosette base diameter, Biggest leaf lengt, Biggest leaf width, Smallest leaf length, Smallest leaf width, Number of lateral pinnae, Terminal lobe length, Terminal lobe width, Length of a well-developed terminal leaflet, Lateral lobe length, Width of a well-developed terminal leaflet, Leaf margin, Hairiness in the axil leaves, Number of rosette scapes, Scapes length, Number of branches in the scapes, Height of scape branches insertion, Length of scape branches, Number of bracts in the scapes, Length of the scapes bracts, Length of the invlucre, Width of the involucre, Number of bracts per involucre, Largest bract length, Largest bract width, Smallest bract length, Smallest bract width, Floret tube length, Floret ligule length, Floret ligule width, Anthers tube length, Style length, Style branches length, Achene length, Achene width, Ribs per achene side, Pappus length File name: 2.Sonchus_boulosii_CHROMOSOMES.xls Description: chromosomes morphology and karyograms indexes File format: Excel Variable list: Chromosome arms length, Chromosome size, Chromosome relative length, Chromosome morphology, Stebbins coefficient, Romero Zarco A1 and A2 coefficients File name: 3.Sonchus_boulosii-Sonchinae_ITS_180509.txt Description: Nucleotidde sequences of ITS/ETS regions File format: TXT Variable list: Species, Sequences File name: 4.Sonchus_boulosii-Sonchinae_matK_180509.txt Description: Nucleotidde sequences of cpDNA matK region File format: TXT Variable list: Species, Sequences File name: 5.Sonchus_boulosii GenBank Accesin Description: Number of accesions in GenBank to localise Nucleotidde sequences File format: Word Variable list: Accesion numbers File name: 6.Sonchus_boulosii_Collections Description: Collections of Sonchus boulosii, with indication of material used for species morphological description, phylogenetic analysis and karyological studies. File format: Word Variable list: Common collection data, analysis applied 3. Relationship between files: [ Obligatorio si es aplicable | Relación entre los archivos] 4. File format: [ Obligatorio | Formato del archivo] 5. If the dataset includes multiple files, specify the directory structure and relationships between the files: [ Obligatorio si es aplicable | Si el conjunto de datos incluye varios archivos, indique la estructura de directorios y las relaciones entre los archivos] SPECIFIC INFORMATION FOR TABULAR DATA ------------------------------------------- [Este apartado se debe repetir para cada archivo de datos que requiera la explicación de variables (habitualmente datos tabulados). Se describirán todas las variables, incluyendo las unidades de medida.] 1. Name file: [Opcional | Nombre del archivo] 2. Number of rows and columns: [Opcional |Número de filas y columnas] 3. Variables list: [Opcional | Repita la estructura para cada variable.] Variable name: Description: Units of measure or value labels | Unidades de medida o etiquetas de valor: 4. Codes or symbols for missing data: [Opcional | Repita la estructura para cada código o símbolo que faltan] Code or symbol: Definition: 5. Special formats or abbreviations used: [Opcional |Formatos especiales o abreviaturas utilizadas] MORE INFORMATION -------------- [Include any other information about the dataset that is not reflected in this template and that you consider relevant. Incluya cualquier otra información sobre el conjunto de datos que no haya quedado reflejada en esta plantilla y que considere relevante]